为提高训练的效果和建立有效的指挥体系，李月和荔非元礼商量后，又把军队打散，重新分成十二个队，八十人为一队，每队设队正一名，队副一名；每队下再设四伙，每伙二十人，伙长一人。全军再分成四个营，三个队为一营，长官为校尉。四个校尉就在原来的军官中由全体士兵投票选出，另外设立宪兵队共四十人，主要是原来的军官和挑选出来的士卒来担任，直属李月。李月任都尉、荔非元礼任果毅都尉，再命即墨担任骑射总教头，教授士兵们马术、刀法和箭法及太玄经第一层的内功心法。由李月、荔非元礼、四个校尉共六人组成最高决策小组，全军所有的命令都由最高决策小组商量决定。李月把这支临时军队命为黑旗军，以黑旗为军旗。编制完成后，全军便投入到了残酷的体能训练之中，主要是负重越野跑，每人负二十斤铁砂，先是五里、慢慢增加到十里、然后是二十里、最后是五十里。其次是蹲马步，一蹲就是二、三个时辰，为了培养团队意识，李月采用竞赛制度，以营为单位，每五天一次竞赛比拼，获胜营可得重奖，再设百人榜，入榜的个人也可按名次获奖，另外排进百人榜最多的一个队，其队正和队副也能得重奖。同时又设耻辱榜，在每次竞赛的最后的一百人，凡十七岁以上，四十岁以下者，且无伤病的，均要上榜，这个耻辱榜比百人榜的效果还要好，没上榜者，心中暗舒一口气，不幸上榜者，无不拼命训练，以图用下次竞赛来洗脱耻辱。今天是第四次竞赛日，内容是二十里负重越野跑，除校尉级以上军官外，其他人均要参加，众人持红牌开赛，十里处换白牌跑回，这是一个校尉想的办法，是为了防止中途有人**，不过李月的军规更严，途中扰民者斩！**者斩！李月黑旗一挥，一千名士卒冲出营寨，这次的第一名者可得白银二百两，是以人人争先，个个奋勇，以图获得好的名次，赵王府除了日常的伙食和后勤，另外还拿出三万两银子专门给李月使用，在重奖的激励和残酷的训练下，效果极为显著。“仅用二十天，一支老弱之军就被训练成了一支铁军”荔非元礼在后来的军事学校的开幕式上这样评论。荔非元礼和二名校尉在大营留守，另外两名校尉在十里处换牌，李月带着即墨骑马随军监视，在泅过一条小河后，李月听到前面有两名军士在边跑边说，他认出两个人是第一营第三队的队正蔡明德和一名同乡的老兵，李月放轻了马步，所以他们并没有看见李月就在自己身后。